Cada punto del gráfico representa el promedio de las intensidades de 3 espectros.
El método de partición seleccionado fue hierarchical k-means clustering, posteriormente las observaciones se representaron usando análisis de componentes principales (PCA); las dimensiones 1 y 2 explican el 72.4% de la variación total de los datos.
Se puede observar la formación de 4 clusters homogeneos y no superpuestos. La variación observada en los grupos NMP y b58 es mínima, esto se deduce de la ausencia de intervalo de confianza para ambos clusters. Caso contrario, los clusters f127 y b96 forman clusters con mayor variación, lo cuál de nuevo se deduce del tamaño de los intervalos de confianza del 95%.
Los perfiles de proteínas obtenidos por la técnica de MALDI-TOF-MS de las Pae crecidas en los distintos soportes son diferenciables mediante el algoritmo Hierarchical k-means clustering-PCA. Los tres soportes originan perfiles diferenciables del control NMP y con similitudes entre ellos. El soporte b58 es el que origina el grupo con menor variación.
Cada punto del gráfico representa el promedio de las intensidades de 3 espectros.
Se uso la información de los mejores 20 picos encontrados por BDA.
El método de partición seleccionado fue hierarchical k-means clustering, posteriormente las observaciones se representaron usando análisis de componentes principales (PCA); las dimensiones 1 y 2 explican el 93.4% de la variación total de los datos. Los perfiles de las Pae crecidas sobre estos soportes son completamente diferenciables.
Cada punto del gráfico representa el promedio de las intensidades de 3 espectros.
Se uso la información de los mejores 20 picos encontrados por BDA.
El método de partición seleccionado fue hierarchical k-means clustering, posteriormente las observaciones se representaron usando análisis de componentes principales (PCA); las dimensiones 1 y 2 explican el 80.9% de la variación total de los datos. Los perfiles de las Pae crecidas sobre estos soportes altamente diferenciables.
Cada punto del gráfico representa el promedio de las intensidades de 3 espectros.
Se uso la información de los mejores 20 picos encontrados por BDA.
El método de partición seleccionado fue hierarchical k-means clustering, posteriormente las observaciones se representaron usando análisis de componentes principales (PCA); las dimensiones 1 y 2 explican el 91% de la variación total de los datos. Los perfiles de las Pae crecidas sobre estos soportes altamente diferenciables.
La red intenta mostrar la relación existente entre los 15 picos discriminantes de cada uno de los distintos modelos BDA probados. Las referencias de los nombres de los modelos son los siguientes: b58_NMP.b58 (Comparación de grupo b58 vs NMP y el pico que tiene asociado está diferencialmente presente en el grupo b58). Los valores de los picos se dividieron por 10, se redondearon y se multiplicaron por 10; de esta forma los valores de picos en realidad cubren un intervalo de 10 Da.
El código de colores muestra aquellos picos discriminantes que se expresan diferencialmente dentro de cada sub-grupo y aquellos que se expresan en todos los grupos.
En rojo se muestra el intervalo 3610 (corresponde a los picos 3610, 3611 y 3612), este intervalo se encuentra aumentado en los tres grupos mesoporosos al compararlos con el grupo NMP.
En azul se muestran los intervalos 2730 (corresponde a los picos 2727 y 2730), 5450 (corresponde a los picos 5447, 5448, 5450), 2910 (corresponde a los picos 2910, 2911, 2913) y 2110 (corresponde al pico 2107). Estos intervalos se encuentran aumentados en los sub-grupos NMP de cada comparación, o lo que es igual se encuentran siempre e indistintanmente disminuidos en los grupos b58, b96 y f127.
En amarillo se muestran los intervalos 7220 (corresponde al pico 7216), 8140 (corresponde al pico 8135), y 11530 (corresponde al pico 11530). Estos intervalos se encuentran aumentados sólo en el grupo b58.
En verde se muestran los intervalos 9770 (corresponde al pico 9770), 9700 (corresponde al pico 9698), y 8350 (corresponde al pico 8347). Estos intervalos se encuentran aumentados sólo en el grupo f127.
En fucsia se muestran los intervalos 4530 (corresponde al pico 4533), 8170 (corresponde al pico 8172), 11430 (corresponde al pico 11433) y 4623 (corresponde al pico 11530). Estos intervalos se encuentran aumentados sólo en el grupo b96.